美国与墨西哥接壤的边境地带，火眼航安因为管理混乱成了毒贩们的天堂。
张君宝（李连杰）与董天宝（钱小豪）是一对自幼在少林寺长大的师兄弟，金睛检员夹带但两人性格迥异，金睛检员夹带张君宝善良忠厚，董天宝则狡猾阴险，在争夺进入达摩院修行的资格时，两人因与师伯发生争执，被逐出少林。为替义士报仇，查获也为帮民除害，查获张君宝在秋雪（杨紫琼）的帮助下，从其师傅的气功心法中悟出一套武林奇功太极拳，开始勤加练习，准备不日与敌手来场血战。
宦官弄权的明朝末年，分拆仿苛税与暴政弄得民不聊生。出寺后，火眼航安两人因志向渐不同而分道扬镳，董天宝贪图荣华参军，张君宝则与一群仁人志士一起劫富济贫。为求高官，金睛检员夹带董天宝向大宦官刘瑾出卖大批旧友，一时间血流成河
可是贪欲已被勾起，查获一向极为谨慎的他也开始动摇。子虚乌有的谣言，分拆仿竟渐渐成真。
众人都以为他们要趁回归前，火眼航安成就犯罪界的最後辉煌。
1997年初，金睛检员夹带卓子强、叶国欢、季正雄互不相识，却恰巧在同一家酒楼出现。龙仔，查获是龙形拳掌门人余英年之独子，原是学武材料，偏是正途功夫不学，专学偷机。
余英年患有难言隐疾，分拆仿三年必发一次。这时，火眼航安忽来一名神秘白衣士上门挑战，余英年带病迎战，败在白衣秀才手下，及后伤重去世……。
今日猝然再发，金睛检员夹带己是十八年来第六次兄弟患难二十载，查获知人知面不知心……仇恨交织，展开一场激烈的厮杀
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